刚接触虚拟筛选 不知道怎样选择化合物库？

药物设计是随着药物化学学科的诞生相应出现的。早在２０世纪２０年代以前，就开始进行天然有效成分的结构改造，而目前药物设计的方向主要集中在小分子方面，尤其是在里宾斯基五原则、RO3 原则等药物设计的经典原则出现后，人们对化合物的选择方向也发生了变化。目前市场热点主要集中在：小分子杂环化合物、天然产物、肽类、糖类等等。世界上也随之出现了很多商业公司专门为药物设计和发现提供各类用于筛选的化合物以提高工作效率（算是一种社会劳动分工）。现在随着计算机辅助设计和化合物推广的需要，几乎所有的这类公司都推出自己的 SDF，DB 等格式的筛选化合物电子库,而且还有一些专业网站收集这些产品库做成一个更大的库，下面就一一详细介绍。

综合产品库

有一些网站拿了厂家或者国家的钱然后建立了一个整合的产品库，以产品数量众多而闻名。例如：

ZINC 库，http://zinc.docking.org/一个受到政府资助的免费库，名气很大。对于入门同学来说应该比较合适，唯一的问题是很多筛出来的结果买不到实体化合物或者供应商太分散，不知道该去哪里找。当然，你可以找专门做多样性筛选库的公司来帮助查找和从国外采购。好处是除了省事儿，如果有其他客户一起买，还能拼个单，节省些运费。

Emolecules 库 http://www.emolecules.com/这个库是专门推广小分子的，里面也有 SDF 等格式的产品下载，还可以按照基团搜索后再下载 SDF 还有一些做过 Docking 或者 QSAR 的指向性产品库（个人觉得这些东西对虚筛的没用，大家更感兴趣的不是这个库而是他们建立的方法）

Molport，Ambinter：这两个属于国外的贸易公司，如果从这两家公司购买，他们也是分别订购并加收高额的服务费；

原厂产品库

先推荐几个国内能买到产品库（数据免费提供给可以和楼主联系）：

1. Chemdiv 库
www.chemdiv.com
http://www.tsbiochem.com/screening2_cid_1_pid_26.html

美国 chemdiv 化合物库是世界上最大的筛选化合物库供应商，有 150 万个多样性的小分子；骨架也是世界上最多的，有多达 4000 种骨架，这样整个库的的多样性就上去了。比如你可以一骨架挑 1-2 个，这样组成 1 万个左右的多样性库，供高通量筛选使用。

另外，Chemdiv 也可以提供经过计算机虚拟筛选的化合物，如 GPCR 库，CNS 库，抗病毒库和农药库等。需要数据的可以直接和 Chemdiv 在国内的战略合作伙伴陶素生化要就行了，这里不做广告。Chemdiv 每年化合物更新的数量在 20 万个左右，所以产品还是比较新颖的。

2. Enamine 库
www.enamine.net

乌克兰国家级研究院背景，有 130 多万种产品，包含杂环和一部分短肽。比 Chemdiv 少一些，但比 Chembridge 的 70 万的数量要多，也有些做过虚筛的子库，还有个农药库。数据同上，可以一起找要。

3. Chembridge 库

广告和展会做的很多，总的产品有 60 万种，但他们喜欢提供溶液装的，如果是发往中国的，在海关会相对复杂些，因为 DMSO 的包装可能要加干冰，但海关会把加干冰的产品认定为危险品，有朋友买了在海关放了三个月还没有出来的。

4. Lifechemicals 库
http://www.lifechemicals.com/

这个也是乌克兰的一家供应商，有 90 多万个产品，其中有库存的是 41 万个，注意上面说的 chemdiv 150 万个小分子和 Enamine130 万个小分子是都有库存的。所以说他们的库存量不算大。

这四个库加起来有 400 多万了，一般做化合物筛选的都够用了。有兴趣或者有特殊要求的可以联系楼主，也可站内 PM 我索要。记住，筛选的时候最好一个大库一个大库的筛，因为工厂的价格是和一次购买的产品产品数量有关的，如果分散到各个库里，那么平均到每个工厂的数量就少了，价格就上去了，国际运费还要高很多。

至于说产品的形式，之前也有人介绍过，尽量买干粉的，要不然冷冻液体的运费的确是会比较贵的，反复冻融还容易分解和变质，不利于产品的长期储存。如果需要比 1 mg 还小的量，可以询问工厂 0.4umol 的 dry film 干膜的，回来直接用 DMSO 溶解就好。这样运输，保存都会方便的多。